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Commit f1b296c

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1 parent f7daf76 commit f1b296c

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DESCRIPTION

Lines changed: 1 addition & 1 deletion
Original file line numberDiff line numberDiff line change
@@ -1,5 +1,5 @@
11
Package: BioDataScience2
2-
Version: 2025.9.0
2+
Version: 2025.10.0
33
Title: A Series of Learnr Documents for Biological Data Science 2
44
Description: Interactive documents using learnr for studying biological data science (second course).
55
Authors@R: c(

NEWS.md

Lines changed: 4 additions & 0 deletions
Original file line numberDiff line numberDiff line change
@@ -1,3 +1,7 @@
1+
# BioDataScience2 2025.10.0
2+
3+
- Learnrs **B10La_som** revised for 2025-2026.
4+
15
# BioDataScience2 2025.9.0
26

37
- Learnrs **B09La_db** and **B09Lb_mds** revised for 2025-2026.

inst/tutorials/B10La_som/B10La_som.Rmd.inactivated renamed to inst/tutorials/B10La_som/B10La_som.Rmd

Lines changed: 32 additions & 2 deletions
Original file line numberDiff line numberDiff line change
@@ -13,8 +13,38 @@ runtime: shiny_prerendered
1313

1414
```{r setup, include=FALSE}
1515
BioDataScience2::learnr_setup()
16-
SciViews::R("explore")
16+
SciViews::R("explore", lang = "fr")
17+
# Required for RSConnect
18+
# SciViews::R
19+
library(rlang)
20+
library(data.table)
21+
library(ggplot2)
22+
library(tibble)
23+
library(tidyr)
24+
library(dplyr)
25+
library(dtplyr)
26+
library(broom)
27+
library(forcats)
28+
library(collapse)
29+
library(fs)
30+
library(data.trame)
31+
library(svFast)
32+
library(svTidy)
33+
library(svMisc)
34+
library(svBase)
35+
library(svFlow)
36+
library(data.io)
37+
library(chart)
38+
library(tabularise)
39+
library(SciViews)
40+
# ... more
41+
library(readxl)
42+
library(testthat)
43+
library(equatags)
44+
# 'explore' packages
45+
library(exploreit)
1746
library(kohonen)
47+
library(vegan)
1848
1949
# Preparation du jeu de données
2050
read("varechem", package = "vegan") %>.%
@@ -45,7 +75,7 @@ Le tutoriel learnr sur les cartes auto-adaptatives (SOM) que vous vous apprêtez
4575
- comprendre comment réaliser les différentes étapes de la SOM : transformation du jeu de données en matrice, calcul de la SOM et représentation sous forme de différents graphiques
4676
- acquérir les outils nécessaires à l'analyse et l'interprétation d'un jeu de données multivariées grâce à la SOM
4777

48-
Avant toute chose, assurez-vous d'avoir bien compris le contenu du [module 10](https://wp.sciviews.org/sdd-umons2/?iframe=wp.sciviews.org/sdd-umons2-2023/cartes-auto-adaptatives-som.html) du cours. N'oubliez pas de réaliser les exercices H5P qui figurent dans cette section avant de vous lancer dans ce tutoriel.
78+
Avant toute chose, assurez-vous d'avoir bien compris le contenu du [module 10](https://wp.sciviews.org/sdd-umons2/?iframe=wp.sciviews.org/sdd-umons2-2025/cartes-auto-adaptatives-som.html) du cours. N'oubliez pas de réaliser les exercices H5P qui figurent dans cette section avant de vous lancer dans ce tutoriel.
4979

5080
## Données environnementales
5181

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