sdd1_module12 initialisation du projet

Author: GuyliannEngels

.gitignore

@@ -0,0 +1,4 @@
+.Rproj.user
+.Rhistory
+.RData
+.Ruserdata

README.md

@@ -0,0 +1,16 @@
+# Mise en pratique du Module 12 Corrélation
+
+## Avant-propos
+
+Il est possible que ce document évolue au cours du temps. N'hésitez pas à vérifier le lien suivant afin de voir les modifications dans les consignes : <https://github.com/BioDataScience-Course/sdd1_module12>
+
+**Ce projet est un projet court et cadré.** 
+
+## Objectif
+
+- Au sein du fichier `anscombe.Rmd`, complétez les zones manquantes.
+
+- Créez une présentation de type dia avec R. Le type de présentation est libre. Utilisez le jeu de données `biometry` du package `BioDataScience`. Vous devez avoir au moins 3 slides. Ce document doit se nommer `presentation`
+
+- Au sein du fichier `critique.Rmd`. Choissisez une image proposée dnas la section Critique statistique et critiquez cette dernière.
+

analysis/anscombe.Rmd

@@ -0,0 +1,70 @@
+---
+title: "Anscombe"
+author: '...'
+date: "3/17/2020"
+output: html_document
+---
+
+```{r setup}
+SciViews::R
+```
+
+# Objectif
+
+Ce document s'intéresse à la réalisation d'exercice sur l'association de deux variables.
+
+# Situation 
+
+Un jeu de données artificiel appelé “quartet d’Anscombe” montre très bien comment des données très différentes peuvent avoir même moyenne, même variance et même coefficient de corrélation. Ce n’est qu’avec un graphique en nuage de points (ou matrice de nuages de points, voir plus loin) qu’il est possible de détecter le problème.
+
+Ce jeu de données est brièvement traité dans la section : [Importance des graphiques](http://biodatascience-course.sciviews.org/sdd-umons/association-de-deux-variables.html#importance-des-graphiques).
+
+
+# Analyse
+
+> Importez le jeu de données anscombe du package `datasets` Complétez la fonction read ci-dessous
+
+```{r importation}
+ans <- read("...", package = "...")
+```
+
+> Réalisez un nuage de point de la variable y1 en fonction de x1. Commentez en une phrase le résultat de cette première fonction.
+
+```{r graph1}
+chart(...) +
+  geom_point()
+```
+
+> Réalisez un test de corrélation avec la méthode de Pearson et avec la méthode de spearman. Comparez les résultats obtenues.  Commentez en 4 phrases le résultat de ces fonctions (Quelle est la valeur des estimateurs ? Quelle est la valeur des p value ? Est ce que les p value sont identiques ?). 
+
+```{r cortest1}
+# test de corrélation Pearson
+cor.test(..., method = "pearson")
+# test de correlation de Spearman
+cor.test(..., method = "spearman")
+```
+
+
+> Réalisez un test de corrélation de la variable y1 ~ x1 et un test de corrélation de la variable y3 ~ x3 avec la méthode Pearson. Commentez en 4 phrases le résultat de ces fonctions (Quelle est la valeur des estimateurs ? Quelle est la valeur des p value ? Est ce que les p value sont identiques ?). 
+
+```{r cortest2}
+# cor.test() y1 ~ x1
+
+# cor.test() y3 ~ x3
+# 
+```
+
+> Réalisez un présente les nuage de points  de la variable y1 en fonction de x1 et la variable y3 en fonction de x3 avec la méthode Pearson. Commentez en 4 phrases le résultat de ces graphiques avec les résultat des tests de corrélation. 
+
+```{r graph2}
+a <- chart()
+
+b <- chart()
+
+combine_charts(list(a,b))
+```
+
+# Conclusion
+
+> Réalisez un petite conclusion de maximum 2 lignes sur les éléments importants que vous avez vu qans ce document.
+

analysis/critique.Rmd

@@ -0,0 +1,23 @@
+---
+title: "Critique statistique"
+author: '...'
+date: "3/17/2020"
+output: html_document
+---
+
+
+# Description de la situation 
+
+> Dans cette section vous devez choisir le graphique que vous allez traiter et le décrire. Vous pouvez employez un graphique dans la section [Critique statistique](http://biodatascience-course.sciviews.org/sdd-umons/critique-statistique.html) ou bien en choisir un autre. 
+
+![]()
+
+
+
+# Mise en avant des éléments incorrectes.
+
+> Dans cette section vous devez expliquer toutes les erreurs vues.
+
+# Idée d'amélioration 
+
+> Cette section doit contenir vos propositions d'amélioration. 

sdd1_module12.Rproj

@@ -0,0 +1,15 @@
+Version: 1.0
+
+RestoreWorkspace: Default
+SaveWorkspace: Default
+AlwaysSaveHistory: Default
+
+EnableCodeIndexing: Yes
+UseSpacesForTab: Yes
+NumSpacesForTab: 2
+Encoding: UTF-8
+
+RnwWeave: knitr
+LaTeX: XeLaTeX
+
+AutoAppendNewline: Yes