guide-R/analyses_avancees/choix-modele

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guide-R/analyses_avancees/choix-modele

https://larmarange.github.io/guide-R/analyses_avancees/choix-modele.html

[egoberville]

Merci pour ce super tableau ! Pour avoir voulu essayer un glmm en famille poisson, il me semble que "lme4::glmer()
avec family = quasipoisson" ne fonctionne pas : "quasi" families cannot be used in glmer

[larmarange]

Tiens. je ne savais pas. Vous avez eu un message d'erreur spécifique ?

[egoberville]

Merci pour votre réponse rapide. Voici le message que j'obtiens à la suite de mon modèle :

mod1 <- glmer(richness ~ ZONE * Periode + (1 | SITE), 
+               data = data_glmm, family = quasipoisson)
Erreur dans lme4::glFormula(formula = richness ~ ZONE * Periode + (1 | SITE),  : 
  "quasi" families cannot be used in glmer

Si vous avez un conseil, je suis preneur ! Merci !

[larmarange]

Merci du retour. Je vais actualiser le tableau.

Dans votre cas, vous pourriez passer a un modèle négatif binomial non ?

[egoberville]

Merci à vous pour vos réponses rapides !
En effet, après avoir fait un peu de littérature sur le sujet, un modèle négatif binomial semblerait adapté pour intégrer ce risque de sur-dispersion, même si celui-ci n'est pas aussi important que je ne le pensais, dans ce cas d'étude. Je me suis également penché sur l'approche suggérée par Harrison (2014) (https://doi.org/10.7717/peerj.616) que je ne connaissais pas du tout. Je me permets d'ajouter cette information si elle s'avère pertinente pour de futurs utilisateurs.

[larmarange]

Merci du partage